Yaban hayatı koruma biyoloğu olan Emre, Türkiye'de kurtlar (1999), çizgili sırtlanlar (2002), leoparlar (2009) ve yaban kedileri (2011) üzerine öncü saha çalışmaları gerçekleştirdi. Ulusal ölçekteki büyük memeli envanter çalışmalarının başlaması ve büyük etobur türlerin yasal koruma statülerine kavuşması için yapılan çalışmalara katkı sağladı (2003). İngiltere’deki Oxford Üniversitesi’nde sekiz yılı aşkın bir süre, ayı türleri, kaplanlar ve zoonotik hastalıklar üzerine projeler gerçekleștirdi. Nepal Himalayaları’ndaki leopar projesi kapsamında, tür için dünya rekoru olan 3,500 metre yükseklikte bir bulutlu leopar popülasyonu keşfetti (2015). Çalışmaları yedi ülkeyi kapsıyor. Yirmiden fazla ülkeden öğrenci ve uzman eğitti ve halen Ankara Üniversitesi Biyoloji Bölümü’nde öğretim üyesi.